うーん、そちらのほうが読みやすいというわけでもないんだけど、どうしてそうなるんだろう？　これは私見だけど、 これはおそらく雰囲気という漢字を覚える前に音として「フインキ」という言葉を覚えてしまうからじゃないだろうか。このあたり漢字変換で 「ふいんき」で変換できなくて気づく人が多いことから推測できる（このあたり「ふいんき なぜか変換できない」というキーワード検索がけっこう多い）。
以前からこういう言葉の発音の変化はあったとは思うけども、ここにきて日本人の漢字力（語彙力とも）が低下してきたことによって、 今後このようなケースは増えるんじゃないかと思う。

で日経１１日夕刊（だったかな）に、この「雰囲気」に関する記事があったんだけど、実は山茶花（さざんか）って「さんざか」 って読んだらしい。確かに字と音と照らしあわせるとそうだなあと納得。
次は「秋葉原」が「あきばはら」？？